La COMPA agit aujourd'hui en priorité sur les têtes des sous-bassins versants, c'est-à-dire au niveau des sources des cours d'eau. 

• Restauration de la ripisylve (végétation des berges) : débroussaillage, plantations, élagage avant les travaux sur le lit mineur(2)… 
• Restauration de la morphologie des cours d’eau : redonner une forme naturelle à la rivière, pour varier le débit, la profondeur de l’eau… 
• Aménagement d’ouvrages (équipements pour réguler l'eau, comme les barrages, vannes, vantelles...) pour la libre circulation des poissons et sédiments : restauration de la continuité écologique 
• Études complémentaires sur les ouvrages les plus impactants 
• Lutte contre les espèces invasives (ragondins, jussie...) sur les zones de travaux 
• Plantation de haies 
• Aménagement de zones tampons pour lutter contre les ruissellements et les transferts de polluants lorsque l'eau rejoint le milieu naturel 
• Sensibilisation envers les agriculteurs, les scolaires et les techniciens (agents communaux des espaces verts, etc.) et grand public 

Le programme est soutenu financièrement par l'Agence de l'eau Loire-Bretagne, la Région des Pays de la Loire et le Département de Loire-Atlantique. 

(1) Liste non exhaustive
(2) Lit mineur/majeur : En période de crue, la rivière sort de son lit mineur pour inonder son lit majeur.